纯种肉牛主要包括亲缘繁育(近交)和晶系育种两个方面。
亲缘繁育:亲缘繁育是指有亲缘关系的公母牛间的交配组合。近交也称近亲繁殖。反映近亲程度的参数是近交系数和亲缘系数。近交系数是表示杂合基因比例降低的一个度量。亲缘繁育既能使某些优良基因纯化,也能使某些隐性不利基因纯合而暴露出来,表现为不良性状而成为不良个体,如体格变小、体质变弱、生产性能降低、畸形发育等。防止近交衰退的方法是:一是近亲交配只用1次或2次,然后用中亲或远亲交配,以保持其优良性状;二是严格选择,防止有共同缺点的公母牛交配;三是严格淘汰那些突变型和重新结合的纯合劣质基因型的不良个体。